To muszą być w takim razie wpisy z zamierzchłych wersji, bo w kodzie przebudowa na small jest z takim właśnie prefiksem:
$smallImage = \IPS\File::create( 'gallery_Images', 'small.' . $file->originalFilename, $this->_createImage( $file, explode( 'x', \IPS\Settings::i()->gallery_small_dims ), \IPS\Settings::i()->gallery_use_square_thumbnails, in_array( 'small', $watermarks ) ) );
Ja bym to naprawił w najprostszy możliwy sposób. Pobrał wszystkie plik z sml zachowując strukturę folderów. Potem przy użyciu ogólnodostępnego narzędzia do masowej zmiany nazw plików zmienił sml na small i wrzucił pliki wynikowe na FTP. Czasochłonne, ale mało inwazyjne i pewne. ?